MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Erwinia pyrifoliae Ep1/96 plasmid pEP05

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013265	AGA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259647812
2	NC_013265	AAG	2	6	858	863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259647812
3	NC_013265	AT	3	6	883	888	50 %	50 %	0 %	0 %	259647812
4	NC_013265	CAT	2	6	997	1002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259647812
5	NC_013265	TTA	2	6	1031	1036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	259647812
6	NC_013265	ACA	2	6	1077	1082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	259647812
7	NC_013265	A	6	6	1095	1100	100 %	0 %	0 %	0 %	259647812
8	NC_013265	GGAC	2	8	1183	1190	25 %	0 %	50 %	25 %	259647812
9	NC_013265	CAGC	2	8	1218	1225	25 %	0 %	25 %	50 %	259647812
10	NC_013265	ACG	2	6	1308	1313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647812
11	NC_013265	GCGG	2	8	1377	1384	0 %	0 %	75 %	25 %	259647812
12	NC_013265	GCG	2	6	1447	1452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259647812
13	NC_013265	GAA	2	6	1464	1469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259647812
14	NC_013265	AGC	2	6	1493	1498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647812
15	NC_013265	GCG	2	6	1534	1539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259647812
16	NC_013265	GCT	2	6	1634	1639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647813
17	NC_013265	A	8	8	1662	1669	100 %	0 %	0 %	0 %	259647813
18	NC_013265	ATG	2	6	1681	1686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259647813
19	NC_013265	GGT	2	6	1839	1844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259647813
20	NC_013265	AT	3	6	1913	1918	50 %	50 %	0 %	0 %	259647813
21	NC_013265	ACT	2	6	1928	1933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259647813
22	NC_013265	ATC	2	6	1996	2001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259647813
23	NC_013265	AGA	2	6	2015	2020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259647813
24	NC_013265	GAT	2	6	2088	2093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259647813
25	NC_013265	A	6	6	2172	2177	100 %	0 %	0 %	0 %	259647813
26	NC_013265	GATAT	2	10	2262	2271	40 %	40 %	20 %	0 %	259647814
27	NC_013265	T	6	6	2306	2311	0 %	100 %	0 %	0 %	259647814
28	NC_013265	AAGAT	2	10	2336	2345	60 %	20 %	20 %	0 %	259647814
29	NC_013265	CAA	2	6	2386	2391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	259647814
30	NC_013265	ATA	2	6	2393	2398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	259647814
31	NC_013265	TA	3	6	2404	2409	50 %	50 %	0 %	0 %	259647814
32	NC_013265	TAT	2	6	2432	2437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	259647814
33	NC_013265	CTT	4	12	2452	2463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259647814
34	NC_013265	CTT	2	6	2506	2511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259647814
35	NC_013265	T	6	6	2510	2515	0 %	100 %	0 %	0 %	259647814
36	NC_013265	T	6	6	2521	2526	0 %	100 %	0 %	0 %	259647814
37	NC_013265	AGA	2	6	2528	2533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259647814
38	NC_013265	TCTT	2	8	2559	2566	0 %	75 %	0 %	25 %	259647814
39	NC_013265	CTT	2	6	2585	2590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259647814
40	NC_013265	A	6	6	2610	2615	100 %	0 %	0 %	0 %	259647814
41	NC_013265	CCA	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259647814
42	NC_013265	T	7	7	2680	2686	0 %	100 %	0 %	0 %	259647814
43	NC_013265	CA	4	8	2729	2736	50 %	0 %	0 %	50 %	259647814
44	NC_013265	T	6	6	2747	2752	0 %	100 %	0 %	0 %	259647814
45	NC_013265	CAT	2	6	3035	3040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259647815
46	NC_013265	CGCTGT	2	12	3046	3057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
47	NC_013265	TCCAGC	2	12	3064	3075	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	259647815
48	NC_013265	CTG	3	9	3081	3089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
49	NC_013265	CTG	2	6	3102	3107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
50	NC_013265	GCT	2	6	3151	3156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
51	NC_013265	CCTG	2	8	3172	3179	0 %	25 %	25 %	50 %	259647815
52	NC_013265	CGCT	2	8	3195	3202	0 %	25 %	25 %	50 %	259647815
53	NC_013265	AGT	2	6	3286	3291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259647815
54	NC_013265	CTG	2	6	3293	3298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
55	NC_013265	GCT	2	6	3301	3306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
56	NC_013265	TGC	2	6	3343	3348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
57	NC_013265	TTC	2	6	3375	3380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259647815
58	NC_013265	GCA	2	6	3427	3432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647815
59	NC_013265	CG	3	6	3480	3485	0 %	0 %	50 %	50 %	259647815
60	NC_013265	CTG	2	6	3542	3547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
61	NC_013265	CCA	2	6	3554	3559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259647815
62	NC_013265	GAT	2	6	3605	3610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259647815
63	NC_013265	GGC	2	6	3695	3700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259647815
64	NC_013265	TTCTC	2	10	3706	3715	0 %	60 %	0 %	40 %	259647815
65	NC_013265	CTG	3	9	3788	3796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
66	NC_013265	C	6	6	3876	3881	0 %	0 %	0 %	100 %	259647815
67	NC_013265	ATGCTG	2	12	3895	3906	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	259647815
68	NC_013265	GTG	2	6	3913	3918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259647815
69	NC_013265	CAC	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259647815
70	NC_013265	CTG	2	6	4022	4027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
71	NC_013265	GCTTT	2	10	4034	4043	0 %	60 %	20 %	20 %	259647815
72	NC_013265	CCG	2	6	4071	4076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259647815
73	NC_013265	GCGG	2	8	4145	4152	0 %	0 %	75 %	25 %	259647815
74	NC_013265	CAG	2	6	4191	4196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647815
75	NC_013265	GCC	2	6	4229	4234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259647815
76	NC_013265	T	6	6	4380	4385	0 %	100 %	0 %	0 %	259647815
77	NC_013265	TCC	2	6	4420	4425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	259647815
78	NC_013265	GCA	2	6	4436	4441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647815
79	NC_013265	CAG	2	6	4473	4478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647815
80	NC_013265	GCC	3	9	4497	4505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259647815
81	NC_013265	ATC	2	6	4531	4536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259647815
82	NC_013265	GTT	2	6	4672	4677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	259647816
83	NC_013265	AGC	2	6	4700	4705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647816
84	NC_013265	GAAG	2	8	4718	4725	50 %	0 %	50 %	0 %	259647816
85	NC_013265	CAG	2	6	4804	4809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647816

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.